长春linux培训 Nanopore第9期培训班（线上）持续报名中!

2019年11月至2020年12月，我们完成了8期纳米孔测序数据分析培训班，5期线下，3期线上。学生累计超过200人，为您带来及时实用的纳米孔数据分析技能。由于近期疫情的影响，我们将第9期培训班再次改为线上。本期聚焦“纳米孔宏基因组测序数据分析”。纳米孔测序具有实时、快速、便携、长度长、高通量等特点，特别适合微生物研究。它将在新冠肺炎研究和后续病毒溯源中有重要应用。在这个培训班中，我们将系统地介绍纳米孔测序在宏基因组中的应用。通过这个培训班，你将完成以下六个主题:1。熟悉纳米孔测序；2.病原微生物的快速鉴定；3.新冠肺炎宏基因组测序样品的检测:4.临床样本中病原菌的检测；5.宏基因组数据的可视化；6.纳米孔宏基因组剪接；

课程特点

1、内容丰富，循序渐进，从零开始；

2.以完整项目为例，提供超高配置服务器入门，快速掌握技能；

3、分两个周末，中间用五天的练习时间，效果更好；

4.线上教学，周末可以在家学习，提供录音屏让你回顾；

5.130多页的讲义、400多张PPT纸和600多行案例代码提供了丰富的学习资料。

讲师老师

王瞳

他曾在华大基因工作，拥有超过11年的生物信息学分析经验。擅长基因组拼接，处理过细菌、真菌、宏基因组、动植物、病毒、RNAseq等物种的基因组拼接，处理过illumina、454、pacbio等测序技术数据。纳米孔测序技术专家，写了一篇关于纳米孔测序技术数据分析的中文专栏，已经完成了八期纳米孔的培训。他曾经是华大基因的高级讲师。2015年开始创业，主要做生物信息学培训。中国最早的生物信息学教学视频制作人已经制作了500多个视频。目前已在北京、上海、广州、深圳、哈尔滨、杭州、武汉、南京、长春、青岛、重庆、海口等地组织了41期培训班。，拥有丰富的培训经验和线上线下积累的6000多名学员。微信官方账号“遗传学院”的作者写了600多门生物信息课程。

课程安排

时间

主题

课程安排

1月9日

理解宏基因组

宏基因组简介

宏基因组导论

宏基因组学的最新成就

扩增子测序和宏基因组测序的比较

宏基因组测序的技术难点

纳米孔测序技术介绍

纳米孔测序在宏基因组研究中的应用

二、纳米孔测序的原理

选择合适的纳米孔

纳米孔测序原理

不同测序平台的比较

纳米孔的错误排序

软件和数据库

第三，熟悉Linux系统

登录到Linux系统

传输文件

Linux基本操作

目录结构

写脚本

1月10日

配置数据库

第四，使用bioconda管理生物软件

安装bioconda

安装纳米孔测序分析软件

宏基因组分析软件安装

动词 配置数据库

Nt/nr库

物种分类数据库

Refseq数据库

下载练习数据

物种的分类和鉴定

不及物动词纳米孔数据处理

Fast5文件格式

使用孔雀鱼进行基础调用

拆分条形码

Fastq文件格式

使用纳米绘图控制数据质量

使用过滤器过滤数据

1月11-15日，自学Linux

1月16日

微生物鉴定

七、物种分类和鉴定

物种分类原则

几种分类算法的比较

用离心机进行物种分类

创建索引

结果解释

结果过滤

可视化帕维亚语

八、新冠肺炎样品检测

新冠肺炎宏基因组的测序和检测

九、临床样本检测

文章简介

详细解释

移除主机

丰富目标序列

生物信息法过滤宿主

临床样本鉴定

X.饱和度评估

饱和度评估

批量处理多个样品进行鉴定

1月17日

分组比较

XI。梅根结果的可视化

梅根介绍

合并多样本结果

准备输入文件

数据可视化

十二。邮票分组比较

邮票介绍

Spf文件

准备输入文件

两组之间的比较

多组比较

结果可视化

宏基因组剪接

十三.纳米孔宏基因组剪接

宏基因组剪接原理

为什么宏基因组剪接如此困难？

应该对多少数据进行排序？

使用元碱拼接元基因组

装配结果优化原则

medaka装配结果的误差修正

pilon装配结果的误差校正

racon程序集结果的错误更正

从宏基因组拼接获得细菌完成图

注册说明

培训时间:

第一阶段:2021年1月9日-10日。

第二阶段:2021年1月16日至17日，每天上午9: 00至下午17:00

培训费用:4900元

上课模式:腾讯会议直播

支付类型/方式

也可以在公务卡微信支付宝上扫码支付，会议通知请联系工作人员。

注册过程

常见问题

1.零基础可以学吗？

完全没有问题。我们的培训课程将从零开始，带领大家逐步熟悉与纳米孔测序相关的原理和具体操作。不要害怕你是零基础。不学习，永远是零基础。

2.为什么分为两个阶段？

四天的课程，就从那个周末到两个周末，第一阶段完成后，可以用五天的时间打牢基础，熟悉Linux操作，后面学第二阶段更容易。过去连续三五天内容密度高，需要一定时间消化吸收。为了有更好的训练效果，可以分为两个阶段。

3.你能在课后做自己的分析吗？

是的，我们会在课堂上演示大量的操作案例，将脚本和案例数据放在服务器上，只需要用自己的数据替换即可完成分析。

4.你能开发票吗？

是的，培训费、会议费、数据分析费、技术服务费、排序服务费等。包括培训通知，具体内容可以微信联系发票。

5.应该做哪些准备？

添加微信报名，报名后进入培训交流群。我们会提前介绍一下腾讯会议的具体用途，并预览一下Linux操作。

6.我能把视频看回去吗？

是的，我们会把培训内容记录在屏幕上，上传到腾讯课堂。每位申请人将获得一份免费拷贝，有效期为五年，可以反复观看和学习。

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